Farmacologia di rete dei glicosidi iridoidi di Eucommia ulmoides Oliver contro l'osteoporosi

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Jul 05, 2023

Farmacologia di rete dei glicosidi iridoidi di Eucommia ulmoides Oliver contro l'osteoporosi

Scientific Reports volume 12, Numero articolo: 7430 (2022) Cita questo articolo 2105 Accessi 4 Citazioni Dettagli metriche Eucommia ulmoides Oliver è una delle medicine tradizionali cinesi comunemente usate

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L'Eucommia ulmoides Oliver è uno dei farmaci tradizionali cinesi comunemente usati per il trattamento dell'osteoporosi e i glicosidi iridoidi sono considerati i suoi principi attivi contro l'osteoporosi. Questo studio si propone di chiarire i componenti chimici e il meccanismo molecolare dei glicosidi iridoidi di Eucommia ulmoides Oliver nel trattamento dell'osteoporosi integrando farmacologia di rete e simulazioni molecolari. I glicosidi iridoidi attivi e i loro potenziali bersagli sono stati recuperati dal text mining, nonché dai database Swiss Target Prediction, TargetNet e STITCH. Allo stesso tempo, sono stati utilizzati DisGeNET, GeneCards e il database dei target terapeutici per cercare i target associati all'osteoporosi. È stata costruita una rete di interazione proteina-proteina per analizzare le interazioni tra i bersagli. Quindi, le risorse bioinformatiche DAVID e il progetto R 3.6.3 sono stati utilizzati per eseguire l'analisi di arricchimento dell'ontologia genetica e l'analisi del percorso dell'Enciclopedia dei geni e dei genomi di Kyoto. Inoltre, sono state studiate le interazioni tra composti attivi e potenziali bersagli mediante docking molecolare, simulazione della dinamica molecolare e analisi dell'energia libera di legame. I risultati hanno mostrato che un totale di 12 glicosidi iridoidi sono stati identificati come glicosidi iridoidi attivi di Eucommia ulmoides Oliver nel trattamento dell’osteoporosi. Tra questi, i composti principali erano aucubina, reptoside, geniposide e ajugoside. L'analisi di arricchimento ha suggerito che i glicosidi iridoidi di Eucommia ulmoides Oliver prevenivano l'osteoporosi principalmente attraverso la via di segnalazione PI3K-Akt, la via di segnalazione MAPK e la via di segnalazione degli estrogeni. I risultati del docking molecolare hanno indicato che i 12 glicosidi iridoidi avevano una buona capacità di legame con 25 proteine ​​bersaglio hub, che hanno svolto un ruolo fondamentale nel trattamento dell'osteoporosi. I risultati della dinamica e della meccanica molecolare dell'area superficiale di Poisson-Boltzmann hanno rivelato che questi composti mostravano un legame stabile con i siti attivi delle proteine ​​bersaglio durante le simulazioni. In conclusione, la nostra ricerca ha dimostrato che i glicosidi iridoidi di Eucommia ulmoides Oliver nel trattamento dell’osteoporosi coinvolgono un meccanismo multicomponente, multi-bersaglio e multi-percorso, che ha fornito nuovi suggerimenti e supporto teorico per il trattamento dell’osteoporosi.

L'osteoporosi (OP) è un'epidemia cronica caratterizzata da una ridotta massa ossea e dal deterioramento della microarchitettura ossea, che porta ad un aumento della fragilità ossea e del rischio di fratture e causa un pesante onere economico per la società1. L'eziologia dell'OP è molto complessa e comprende l'interazione di fattori endocrini, nutrizionali, genetici, fisiologici e immunitari2,3. Lo squilibrio tra la formazione ossea degli osteoblasti e il riassorbimento osseo degli osteoclasti è la causa sottostante dell'OP4. Il trattamento dell'OP dipende dalla terapia farmacologica, che comprende bifosfonati, modulatori selettivi del recettore degli estrogeni, agonisti misti dei recettori degli steroidi, anticorpi monoclonali contro RANKL, analoghi dell'ormone paratiroideo e così via5. Questi farmaci possono alleviare la perdita ossea e migliorare i sintomi clinici in una certa misura, ma la loro applicazione clinica a lungo termine è limitata dalla bassa tolleranza, da gravi effetti collaterali e dai costi elevati6. Pertanto, è di grande importanza sviluppare farmaci più sicuri, efficaci ed economici per il trattamento dell’OP.

La medicina tradizionale cinese (MTC) ha una lunga storia in Cina. È sempre più popolare grazie ai vantaggi di un buon effetto curativo, pochi effetti collaterali e un prezzo accessibile7. Nel sistema teorico della MTC, l'OP è riconosciuta come atrofia ossea o sindrome artralgica causata da deficienza renale8. Eucommia ulmoides Oliver (UE) è uno dei materiali medicinali nutrienti più importanti della MTC. È stato scoperto che l’UE può prevenire efficacemente la perdita ossea, migliorare la resistenza biomeccanica dell’osso, prevenire il deterioramento della microarchitettura ossea trabecolare e curare l’OP9,10,11. Ricerche moderne hanno ritenuto che i glicosidi iridoidi siano i principali ingredienti farmacologici dell'EU12,13,14. Esistono molti studi che dimostrano che i glicosidi iridoidi svolgono un ruolo primario nel riassorbimento osseo e nel rimodellamento osseo. I glicosidi iridoidi possono aumentare la differenziazione e l'attività degli osteoblasti, promuovere la formazione ossea, inibire la generazione di osteoclasti, ridurre l'attività degli osteoclasti e limitare il riassorbimento osseo15. Come l'aucubina, potrebbe migliorare la differenziazione degli osteoblasti nelle cellule MG6316. Il geniposide potrebbe indurre la proliferazione e la differenziazione delle cellule MC3T3-E117. Catalpol potrebbe sopprimere l'osteoclastogenesi e attenuare il riassorbimento osseo derivato dagli osteoclasti18. L'asperuloside potrebbe inibire la differenziazione degli osteoclasti e ridurne il numero19. La monotropeina potrebbe promuovere la formazione di osteoblasti e diminuire la produzione di citochine proinfiammatorie negli osteoblasti20. Swertiamarin potrebbe aumentare significativamente il livello di espressione dell'OPG e contrastare l'attività degli osteoclasti21. Questi risultati hanno indicato che i glicosidi iridoidi hanno mostrato potenziali effetti preventivi e terapeutici sull’OP. Tuttavia, ci sono pochi studi sui componenti chimici e sui meccanismi molecolari dei glicosidi iridoidi di Eucommia ulmoides Oliver (IGEU) nel trattamento dell'OP.

 0.4”, disconnected nodes in the network were hidden, and other parameters remained the default settings. Cytoscape 3.8.0 was used to construct and visualize the PPI network47. At the same time, we analyzed the PPI network using the plug-in of “Analyze Network” tool. Network topology analysis, which contains many topological parameters, was applied to network pharmacology, among which edgecount is the most important parameter48. The edgecount of a node refers to the number of other nodes that interact with it49. We selected the nodes with more than twice the median edgecount of all nodes to construct the hub PPI. The correlated targets in hub PPI were identified as the hub targets./p> 4.0 indicates certain binding activity, Total Score > 5.0 indicates good binding activity, while Total Score > 7.0 indicates strong binding activity56. PyMOL 2.4 (https://pymol.org) software was used to visualize the docking results57./p> 5.0 kJ/mol or < − 5.0 kJ/mol were considered to be the critical residues for ligand binding to protein65. The calculation results showed that Trp352 and Tyr335 in AKT1 had strong interactions with reptoside (Fig. 9A). Aucubin had the lowest interaction energy with Leu346. In addition, the binding energy of aucubin with Leu387, His524 and Leu525 were also low (Fig. 9B). The binding of geniposide to MAPK1 was mainly supported by the amino acids’ residues Leu156, Val39, Ile31, Lys54 and Asp111 (Fig. 9C). Analysis of MAPK3-ajugoside complex showed that Leu346, Leu387, His524, Leu525 and Glu353 energetically favor the binding of ajugoside (Fig. 9D). Overall, the identification of critical residues in these proteins facilitated the discovery of new selective inhibitors against OP-related targets./p>